Unidades

El curso cuenta con seis unidades, cada una un el objetivo de conocer y practicar una habilidad de análisis diferente de datos de secuenciación de amplicones o metagenomas usando el software R. Sino tienes experiencia trabajando en R, te recomendamos comenzar con la unidad 1: "Introducción a R: Manipulación de datos y visualización".

Por favor, revisa la lista de unidades disponibles a continuación y haz clic sobre la que quieras practicar para dirigirte al tutorial.

Introducción a R: Manipulación de datos y visualización

Análisis de secuencias de 16S con DADA2

Introducción a phyloseq y a análisis de diversidad

Búsqueda de genes de interés en datos de metagenómica shotgun

Visualización y curación de genomas ensamblados desde metagenomas (MAGs)

Redes de co-ocurrencia de microorganismos

Nota: Para los días del curso suponemos que los participantes han instalado R y RStudio y los paquetes de R necesarios, siguiendo la guía de requerimientos enviada una semana antes. De lo contrario, puedes hacerlo siguiendo los pasos en el siguiente link:

Antes de comenzar: Instalación de R, RStudio y paquetes