Bienvenidos al Curso Pre - Congreso Primer ISME Latin America 2019

Análisis de datos bioinformáticos para metagenomas y amplicones usando R

9 y 10 de septiembre en la Universidad Técnica Federico Santa María, Valparaíso, Chile
isme-la2019.org

Unidades

El curso cuenta con seis unidades, cada una un el objetivo de conocer y practicar una habilidad de análisis diferente de datos de secuenciación de amplicones o metagenomas usando el software R. Sino tienes experiencia trabajando en R, te recomendamos comenzar con la unidad 1: "Introducción a R: Manipulación de datos y visualización".
Por favor, revisa la lista de unidades disponibles a continuación y haz clic sobre la que quieras practicar para dirigirte al tutorial.

Introducción a R: Manipulación de datos y visualización

Análisis de secuencias de 16S con DADA2

Introducción a phyloseq y a análisis de diversidad

Búsqueda de genes de interés en datos de metagenómica shotgun

Visualización y curación de genomas ensamblados desde metagenomas (MAGs)

Redes de co-ocurrencia de microorganismos

Nota: Para los días del curso suponemos que los participantes han instalado R y RStudio y los paquetes de R necesarios, siguiendo la guía de requerimientos enviada una semana antes. De lo contrario, puedes hacerlo siguiendo los pasos en el siguiente link:

Antes de comenzar: Instalación de R, RStudio y paquetes


Este curso es diseñado e impartido por el grupo de Dr. Eduardo Castro-Nallar (eduardo.castro@unab.cl):
Dr. Florence Gutzwiller (florence.gutzwiller@gmail.com) y M.Sc. Katterinne N. Mendez (mendez.katterinne@gmail.com)

CASTRO LAB